三大挑战直接开战游戏为玩家们准备了三种挑战，一个是剧情模式，玩家们将围绕著拯救世界的任务而挑战不同关卡；一个是生存模式，这里就是无尽挑战的地方，唯一的目的就是生存下来，生存得越久，得分越高；最后一种是玩家互动的竞技模式，可以和全世界的玩家一起对战，争夺排行榜。本作并没有太多複杂的系统设置，为玩家提供了三种挑战模式就已经是多的系统了，可以方便很多不愿意麻烦的玩家直接进入战斗体验。《神鬼幻想》丰富的副本系统，让副本探索绝不枯燥无聊。独自挑战的迷之幽穀、需要组队才能更好完成的精英难度的龙穴、需要与其他队伍的玩家进行争夺才能抢到BOSS的方舟遗迹……不同的副本不同的玩法，也需要不同职业通力协作，让喜欢打副本的玩家们感受到不同PVE乐趣的同时，也能体会到与伙伴们并肩作战共闯敌穴的热血沸腾。游戏操作跟雷电系列射击游戏没有多大区别，采用拖拽屏幕的方式来进行躲避敌机的袭击，找准时机，给予对方致命一击。游戏中如果你控制的战机一直只会放最烂的子弹，能玩下去的人寥寥无几。为此玩家在机会敌机时有概率掉落一些增加己方战斗力的道具，有让子弹变得密集，有让子弹数量集中威力更猛的，更有僚机、自动追踪导弹的插入设计，让本来略为冷清的场面变得异常火爆。